Сверхразум не убил Керриган, а поместил в хризалиду на планете Чар. Из кокона она вышла зараженной — но, в отличие от тысяч других жертв Роя, сохранила разум, характер и волю. Так появилась Королева Клинков.
В Brood War она показала, за что ее называют лучшим манипулятором вселенной. Керриган стравила между собой протоссов, терран и соперничающих церебралов, держала под контролем матриарха темных тамплиеров Расзагал, вступила в союз с Рейнором и Фениксом против земного флота — а потом убила и Феникса, и генерала Дюка. К концу войны она правила всеми зергами сектора Копрулу, не проиграв ни одного решающего сражения. Каждый ее союзник умирал, выполнив свою функцию.